AAAA — Acides aminés
Mesurés par chromatographie des acides aminés sanguins et urinaires.
• Indiqués si suspicion d'erreur innée du métabolisme
• Phénylcétonurie, homocystinurie, tyrosinémie, MSUD…
• Souvent 1er bilan métabolique avec NH3, lactates, acylcarnitines — Acides aminés
ACMGACMG — American College of Medical Genetics and Genomics
Société savante américaine de référence en génétique médicale.
• Publie les guidelines de classification des variants (pathogène / bénin / VUS)
• Recommande la CMA comme 1er test pour DI/RGD/MCA/TSA
• Recommande le WES comme test de 1re ou 2e ligne selon contexte (2021) — American College of Medical Genetics and Genomics
aCGHaCGH — Array Comparative Genomic Hybridization
= Puce ADN / CMA (termes souvent interchangeables).
• Compare le génome du patient à un ADN de référence
• Détecte les CNV (délétions/duplications) de ≥50–100 kb
• Résolution 50–100× supérieure au caryotype standard
• Rendement 15–25% dans DI/RGD/MCA — Array Comparative Genomic Hybridization (puce ADN)
ARAR — Autosomique récessif
Mode de transmission génétique : 2 copies mutées nécessaires pour la maladie.
• Parents porteurs sains (hétérozygotes) → 25% de risque à chaque grossesse
• Risque augmenté en cas de consanguinité parentale
• Exemples : phénylcétonurie, mucoviscidose, SLO, galactosémie — Autosomique récessif
ATCDATCD — Antécédents
En génétique pédiatrique, recueillir :
• ATCD personnels : grossesse (RCIU, anomalies écho), période néonatale, développement
• ATCD familiaux sur 3 générations (arbre généalogique)
• Consanguinité, fausses couches répétées, morts inexpliquées chez le jeune — Antécédents
BORBOR — Syndrome Branchio-Oto-Rénal
Gènes : EYA1, SIX1, SIX5. Transmission autosomique dominante.
• Fistule ou kyste branchial (cou)
• Anomalies otiques : atrésie du CAE, malformations ossiculaires, surdité mixte
• Anomalies rénales : agénésie, hypoplasie, dysplasie
→ Écho rénale + audiogramme si appendice pré-auriculaire + autre signe — Syndrome branchio-oto-rénal
CAECAE — Conduit auditif externe
Structure reliant le pavillon de l'oreille au tympan.
• Atrésie du CAE = CAE absent ou fermé → surdité de transmission
• Associé au syndrome BOR, microtie, syndrome de Treacher-Collins
→ Si atrésie unilatérale : bilan audiologique + imagerie (TDM rocher) + génétique — Conduit auditif externe
CMACMA — Chromosomal Microarray Analysis
= Puce ADN / aCGH / CGH-array. 1er test génétique recommandé (ACMG).
• Détecte les CNV (délétions/duplications) à haute résolution
• Rendement 15–25% pour DI/RGD/MCA/TSA
• 5–8× supérieur au caryotype standard
• Limite : ne détecte pas les mutations ponctuelles (SNV) ni anomalies de méthylation
→ Ne remplace pas le test X fragile ni les tests métaboliques — Chromosomal Microarray Analysis
CNVCNV — Copy Number Variant
Variant du nombre de copies d'un segment chromosomique.
• Délétion (perte) ou duplication (gain) de matériel génomique
• Taille : de quelques kb à plusieurs Mb
• Détectés par CMA (aCGH) — pas par le caryotype standard si <5–10 Mb
• Exemples pathogènes : del 22q11, del 7q11 (Williams), del 15q11 — Copy Number Variant (variant du nombre de copies)
DIDI — Déficience intellectuelle
= Retard mental (ancienne terminologie). Critères DSM-5 :
• QI <70 (–2 DS) mesuré par test standardisé
• Déficits des fonctions adaptatives (conceptuelles, sociales, pratiques)
• Début pendant la période développementale (<18 ans)
• Légère (QI 55–70) · Modérée (40–55) · Sévère (25–40) · Profonde (<25)
→ Cause génétique dans 30–50% des cas — CMA en 1re intention — Déficience intellectuelle
FISHFISH — Fluorescence In Situ Hybridization
Hybridation in situ fluorescente — technique de cytogénétique moléculaire.
• Visualise une région chromosomique ciblée avec une sonde fluorescente
• Détecte les microdélétions/duplications ciblées non visibles au caryotype
• Indications : del 22q11, del 7q11.23 (Williams), del 15q11, del 5p (cri du chat)
• Limite : sonde spécifique = 1 région à la fois (≠ CMA qui est pangénomique) — Fluorescence In Situ Hybridization
GDDGDD — Global Developmental Delay
= RGD (Retard Global du Développement) en français.
• Retard significatif dans ≥2 domaines développementaux
• Motricité globale, fine, langage, cognition, social, autonomie
• Utilisé avant 5 ans (avant que les tests de QI soient fiables)
→ Cause génétique dans 30–50% — CMA en 1re intention — Global developmental delay (= RGD)
IDID — Intellectual Disability
= DI (Déficience Intellectuelle) en français. Terme DSM-5 et ICD-11.
• Remplace "mental retardation" dans la littérature anglophone depuis ~2010
• Critères identiques à DI (voir DI)
• Prévalence : 1–3% de la population générale — Intellectual disability (= DI)
MCAMCA — Malformations Congénitales multiples
Anomalies structurelles touchant ≥2 organes ou systèmes, présentes à la naissance.
• Cardiaques + rénales + cranio-faciales = tableau syndromique typique
• Rendement CMA très élevé dans ce groupe (27–40%)
• Indications principales : T21, T18, T13, microdélétions, syndromes polygéniques
→ CMA en urgence dès identification — Malformations congénitales multiples
NDND — Neurodéveloppement
Ensemble des processus biologiques conduisant au développement du système nerveux.
• "Troubles neurodéveloppementaux" (TND) = TSA, TDAH, DI, troubles du langage, DCD
• Cause génétique dans 30–50% des TND significatifs
• Association dysmorphie + ND → rendement génétique maximal (48–63%)
→ CMA puis WES si CMA négatif — Neurodéveloppement / troubles neurodéveloppementaux
NF1NF1 — Neurofibromatose type 1
= Maladie de Recklinghausen. Gène NF1 (17q11.2), AD, pénétrance quasi-complète.
• Taches café au lait ≥6 (≥5 mm prépubère, ≥15 mm post-pubère)
• Neurofibromes cutanés ou plexiformes
• Nodules de Lisch (iris), gliomes optiques, macrocrânie
• Difficultés d'apprentissage dans 50–70%
→ Diagnostic clinique (critères NIH) ; test génétique si doute — Neurofibromatose type 1
OROR — Odds Ratio
Mesure d'association en épidémiologie.
• OR >1 : facteur associé à un risque accru
• OR = 9,34 pour dysmorphie faciale → rendement diagnostic génétique 9× supérieur vs absence de dysmorphie
• OR = 6,69 pour retard moteur → rendement 6× supérieur
• IC95% non chevauchant 1 = statistiquement significatif — Odds ratio
RGDRGD — Retard Global du Développement
= GDD. Retard significatif dans ≥2 domaines développementaux avant 5 ans.
• Domaines : motricité globale, motricité fine, langage, cognition, social
• "Significatif" = ≥2 DS sous la moyenne pour l'âge
• Après 5 ans → on peut poser le diagnostic de DI (tests QI)
→ Indication formelle de CMA en 1re intention — Retard global du développement
RCIURCIU — Retard de Croissance Intra-Utérin
Poids de naissance <10e percentile pour l'âge gestationnel.
• RCIU sévère (<3e percentile) avec dysmorphie → évoquer syndrome génétique
• Syndromes associés : Cornelia de Lange, Silver-Russell, T18, T13
• Silver-Russell : RCIU + macrocéphalie relative + asymétrie corporelle → test méthylation 11p15 — Retard de croissance intra-utérin
SLOSLO — Syndrome Smith-Lemli-Opitz
Gène DHCR7 (11q13), AR. Déficit en 7-déhydrocholestérol réductase.
• Syndactylie 2e-3e orteils (signe pathognomonique !)
• Microcéphalie, microrétrognatisme, implantation basse oreilles
• Anomalies cérébrales, retard statural et psychomoteur variable
→ Doser le 7-déhydrocholestérol plasmatique (↑↑ = diagnostic) — Syndrome Smith-Lemli-Opitz
SNVSNV — Single Nucleotide Variant
Mutation ponctuelle : substitution d'une seule base dans la séquence ADN.
• Anciennement appelé "SNP" ou "mutation ponctuelle"
• Pathogène si dans une région codante (exon) et modifie la protéine
• Non détecté par CMA → nécessite WES ou WGS ou test ciblé
• Exemples : mutations FGFR3 (achondroplasie), MECP2 (Rett), NIPBL (Cornelia de Lange) — Single Nucleotide Variant (mutation ponctuelle)
T21T21 — Trisomie 21 (Syndrome de Down)
Trisomie libre (95%), translocation Robertsonienne (4%), mosaïque (1%).
• 1/700 naissances vivantes
• Dysmorphie caractéristique, hypotonie, DI variable (légère à modérée)
• Cardiopathie (40%), anomalies GI (3%), hypothyroïdie, surdité
→ Caryotype pour confirmer ET préciser le type (risque récidive ≠ selon translocation) — Trisomie 21
TSATSA — Trouble du Spectre Autistique
= Autisme, syndrome d'Asperger, TED (anciennes terminologies). Critères DSM-5 :
• Déficits de la communication/interaction sociale
• Comportements répétitifs, intérêts restreints, sensorialité atypique
• Prévalence : ~1/100 enfants
• Cause génétique identifiable dans 15–40% (CMA, WES, X fragile)
→ CMA recommandée systématiquement + test X fragile si garçon — Trouble du spectre autistique
VUSVUS — Variant de Signification Incertaine
Variant génétique dont la pathogénicité n'est pas établie (classification ACMG).
• Ni clairement pathogène, ni clairement bénin
• Communication aux familles difficile : "nous avons trouvé quelque chose mais ne savons pas si c'est la cause"
• Réévaluation périodique recommandée (bases de données s'enrichissent)
• ~20–30% des résultats WES contiennent un VUS — Variant de signification incertaine
WESWES — Whole Exome Sequencing
Séquençage d'exome entier : analyse de toutes les régions codantes (~1–2% du génome).
• Rendement 37% (méta-analyse 2025, n=55 752)
• Rendement 48–63% si dysmorphie + troubles neurodéveloppementaux
• Détecte les SNV et petites indels — complémentaire à la CMA (CNV)
→ Recommandé après CMA négatif, ou en 1re ligne selon centres (ACMG 2021) — Whole Exome Sequencing
WGSWGS — Whole Genome Sequencing
Séquençage du génome entier (régions codantes + non codantes + régions régulatrices).
• Détecte SNV, CNV, variants structuraux, anomalies de méthylation
• Rendement supérieur au WES (émergent)
• Actuellement : centres spécialisés uniquement, coût élevé, interprétation complexe
→ Futur test de référence unique (remplacera CMA + WES) — Whole Genome Sequencing